بدأت الوزارة بتحول منظومتها الداخلية الى منظومة إلكترونية، بحيث أن يكون جميع الأعمال لموظفين الوزارة إلكترونيا بدلا من ورقيا وبذلك توفر الوزارة الوقت الكثير في سير المعاملات الداخلية.
وحيث أن راحة الموظف تزيد من انتاجه فقد بدأت الوزارة بعملية التحول بسرعة وأصبحت معظم الأعمال التي يقوم بها الموظف إلكترونيا.

ومن الخدمات التي قدمت للموظفين

نظام الإلحاق والترقية والمتابعة

يقوم هذا النظام بخدمة موظفيي الوزارة بحيث يتم إلحاق الطالب المتقدم آليا أو ترقيته وتحويله الى الملحقية المحددة. يقوم هذا النظام بربط آليا بنظام الشؤون الدراسية.
ويتيح النظام القدرة على متابعة الطالب دراسيا من قبل موظفيي الوزارة المختصين بذلك ، بحيث يستطيعون تمديد بعثته أو الموافقة على طلب رحلة علمية وغيرها من الطلبات ، كما ان هذا القسم يحتوي على (25) خدمة إلكترونية .

البوابة الداخلية

والتي هي عبارة عن بوابة خدمية ومعلوماتية للموظفين ممايزيد من كفاءة الأداء وسرعة الوصول الى المعلومة المطلوبة ، كما ان هذا القسم يحتوي على (10) خدمات إلكترونية .

البريد الإلكتروني

وحيث أن قد أصبح البريد الإلكتروني من ضرورات العمل، فقد أولت الوزارة اهتمامها الشديد به، وقد شمل أيضا الدخول على البريد الإلكتروني عن طريق موقع مخصص وذلك لإتاحة متابعة العمل من أي مكان وفي أي وقت.